特许经营备案企业为了保护其知识产权得到最大限度的运用，保护其权益不受到侵犯，通常会对侵犯其特许经营权的行为进行一定的处罚。

　　1、侵犯特许经营商标的行政处罚

　　特许人及受许人发现有侵犯特许商标行为的，有权要求行政主管部门负责商标侵权的处理。

　　一旦认定侵权行为成立，主管部门可以责令侵权人立即停止侵权行为，没收、销毁侵权商品和专门用于制造侵权商品、伪造特许商标的工具，并可处以一定数量的罚金。

　　2、特许经营中商业秘密侵权行政处罚

　　当商业秘密受到侵害时，为防止商业秘密进一步扩散，特许人可以通过专门的行政管理机构(在我国是县级以上工商行政管理部门)申诉，要求侵权人停止使用特许人商业秘密，上缴或销毁侵权人因窃取或违约获得特许人商业秘密的计划、图纸以及有关资料返还特许人，销毁使用特许人商业秘密生产的产品。

　　行政管理机构还可以根据情况基于罚款处罚。如我国《反不正当竞争法》规定对侵犯商业秘密的行为可以根据情节处以1万元以上20万元以下的罚款。

　　3、侵犯特许人专利权的行政处罚

　　特许人及受许人发现有侵犯特许人专利权行为的，有权要求专利主管部门予以查处。

　　以我国为例，一旦认定侵权行为成立，主管部门可以责令侵权人立即停止侵权行为;责令改正，并予以公告;没收、销毁侵权商品和专门用于制造专利侵权商品工具;没收非法所得，并可处以一定数量的罚金。

　　4、侵犯特许著作权的行政处罚

　　对于侵犯著作权的行为，特许人可以要求著作权行政管理部门对侵权行为进行行政处罚。

　　行政处罚的方式主要包括：责令停止侵权行为;没收违法所得;没收、销毁侵权复制品及主要用于制作侵权复制品的工具，并可并处罚金。